新手想问一下“取了一个中心分子和距离它8埃之内的溶剂分子生成pdb”，这个怎么做？

鱼叉君 发表于 2018-11-2 06:34
Sob老师，我发现比如我选择colorID为红色，isovalue大于100的时候，显示了白色的块状，isovalue小于100的 ...

我不清楚你的情况。如果当前只有一个rep用来显示等值面的话，Color ID设的什么颜色，所有等值面就应该是什么颜色。

sobereva 发表于 2018-11-2 05:24
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助及具体内容（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.htm ...

Sob老师，我发现比如我选择colorID为红色，isovalue大于100的时候，显示了白色的块状，isovalue小于100的时候，才会逐渐有红色部分出现，想问下这是什么原因？那如果isovalue选择100以上可以吗

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助及具体内容（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的标题改了。

sdf的平滑程度对统计的帧数非常敏感，帧数越多越平滑。选取能令你感兴趣的区域特征展现出来的值即可。
isovalue不要太小，否则噪音区域也会被显示出来