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各位老师各位同仁，我自己平时做计算用的都是gaussian，对于VASP不是太了解，所以在看文献的时候对于用VASP模拟反应过程有几个很基础的问题，文献正文和SI都附在文末，希望各位不吝赐教
1、一直很想知道像附件中这段描写用VASP是如何操作的“Our AIMD simulations were performed using a cubic box of side length 9.278 Å with periodic conditions; each simulation box consists of 2MEA, 1CO2, and 20H2O molecules, corresponding to E25 wt% aqueous MEA solution.”（出现在正文Fig 1的下方）
是用VASP建立一个盒子，设定一些盒子的边界条件，然后把2MEA, 1CO2, 和 20H2O分子直接丢进盒子里等着它自己运算吗？如果有关于这部操作的详细案子或教程最好
2、还有这个图（正文Fig 1）
这些一步一步的过程都是通过问题1中设置好的盒子自动运算得到的一系列结果吗？可以用类似gaussview的软件读取查看吗？还是属于自己猜想的？
3、还有这个图(SI中的Fig S1)
这是文献中计算反应能的一张图，对于30%浓度的MEA，开始设置盒子里的分子是2MEA, 1CO2和 16H2O，那另外这一组1MEACOO-, 1MEAH+和16H2O是这个盒子在软件自己运算之后得出的结果吗？还是重新设置了一个包含1MEACOO-, 1MEAH+和16H2O的新盒子？
我自己用Gaussian计算能量最后会收敛，起码不是这样波动的吧，VASP计算能量就是这样一直波动的吗？
正文：
Reaction mechanisms of aqueous monoethanolamine with carbon dioxide_ a combined .pdf
(3.25 MB, 下载次数 Times of downloads: 16)
SI：
(SI)Reaction mechanisms of aqueous monoethanolamine with carbon dioxide_ a combi.pdf
(296.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)
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发表于 Post on 2018-4-15 18:30:18
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