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[Amber] 求助resp电荷的模拟

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楼主
各位大神,
     我在进行resp电荷的模拟的时候,在gaussian中有两种模拟方式:
--Link1--
%nproc=1
%chk=molecule
%mem=1024MB
#HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) iop(6/50=1) opt

remark line goes here

1   1
    C  -38.9208000000       15.3014000000      -24.0302000000   
    N  -39.4587000000       15.9888000000      -25.0480000000     
    C  -38.8204000000       17.2099000000      -25.1653000000     

antechamber-ini.esp

antechamber.esp
以及下面这种:
--Link1--
%nproc=1
%chk=molecule
%mem=1024MB
#HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) opt

remark line goes here

1   1
    C  -38.9208000000       15.3014000000      -24.0302000000   
    N  -39.4587000000       15.9888000000      -25.0480000000     
    C  -38.8204000000       17.2099000000      -25.1653000000   
不知道哪一种做法是对的?我感觉两种做出来的静电势很不一样。  


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发表于 Post on 2017-9-21 15:24:31 | 只看该作者 Only view this author
IOp(6/50)

Whether to write Antechamber file during ESP charge fitting.
这个关键词只是把esp的文件单独写出来
然后antechamber的时候用的输入的文件不一样
antechamber -L 或者 直接antechamber 有一堆各种信息

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发表于 Post on 2017-9-21 18:52:38 | 只看该作者 Only view this author
靠iop(6/50=1) 产生esp文件是多余的,对于最新版本情况,antechamber直接就能从Gaussian输出文件中读取计算RESP电荷要用的静电势信息

2019-May-15补充:用ambertools计算RESP电荷的做法已经完全过时,目前算RESP电荷的最理想做法是用Multiwfn程序,极度快速、灵活和方便,见
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果)
http://sobereva.com/476http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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