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[GROMACS] 求助:气相成核模拟的系综选择以及初始模型尺寸如何确定

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本帖最后由 Mice 于 2025-3-25 10:37 编辑

最近在做气相成核(形成团簇)的模拟,计算一下相关的成核速率等,
1.想问一下各位老师系综选用NPT还是NVT,用NVT的话模型的尺寸固定但是不能控压,而选用NPT时盒子尺寸变化也会影响成核速率的计算
2.初始盒子尺寸过小的话会不会是浓度过高导致的成核,还是假设理想气体通过状态方程大致估算一下该压力下的体积

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发表于 Post on 2025-3-25 22:51:25 | 只看该作者 Only view this author
1 一般用NVT。气体体系盒子容易变化剧烈,很难控压
2 是,可能会高估成核速率
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-26 10:14:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-25 22:51
1 一般用NVT。气体体系盒子容易变化剧烈,很难控压
2 是,可能会高估成核速率

好的,谢谢sob老师,那这个初始尺寸通过状态方程去估算可行吗?老师

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