计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: 红茶泡枸杞
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 有关计算MOF/COF与分子之间的结合能疑问

[复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

16#
发表于 Post on 2024-9-12 17:18:58 | 只看该作者 Only view this author
红茶泡枸杞 发表于 2024-9-12 15:59
好的谢谢社长,之前做的1*1*2超胞优化后严重变形,分子内发生了相互作用,现在做1*1*3,Z方向尺寸为11.17 ...

当前z方向仍然偏小
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

100

帖子

0

威望

545

eV
积分
645

Level 4 (黑子)

17#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-13 20:52:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-26 04:17
基组太小,而且此时还不考虑counterpoise算物理吸附能属于开玩笑(做几何优化可以),看http://bbs.keinsci ...

社长您好,请问用CP2K得到周期性体系的波函数文件能否拿来做ESP分析呢?对于COF吸附小分子体系,静电势和范德华势我只做了范德华势可以吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

18#
发表于 Post on 2025-5-13 23:35:08 | 只看该作者 Only view this author
红茶泡枸杞 发表于 2025-5-13 20:52
社长您好,请问用CP2K得到周期性体系的波函数文件能否拿来做ESP分析呢?对于COF吸附小分子体系,静电势和 ...

Multiwfn没法对周期体系基于波函数算静电势。周期性体系的静电势的格点数据文件应当用CP2K直接产生
具体看COF和小分子之间是什么作用,只有范德华作用主导时才可以只考察范德华势
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

100

帖子

0

威望

545

eV
积分
645

Level 4 (黑子)

19#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-14 13:24:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-13 23:35
Multiwfn没法对周期体系基于波函数算静电势。周期性体系的静电势的格点数据文件应当用CP2K直接产生
具体 ...

谢谢社长,我目前做的IGMH散点图中初步得到主要是范德华作用和弱氢键作用,当初计算的时候没有产生静电势的格点数据文件,现在只能做范德华势计算。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

20#
发表于 Post on 2025-5-14 20:06:04 | 只看该作者 Only view this author
红茶泡枸杞 发表于 2025-5-14 13:24
谢谢社长,我目前做的IGMH散点图中初步得到主要是范德华作用和弱氢键作用,当初计算的时候没有产生静电势 ...

重算不就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

100

帖子

0

威望

545

eV
积分
645

Level 4 (黑子)

21#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-15 11:18:31 | 只看该作者 Only view this author

社长,我现在算个单点产生cube文件可以吗?周期性体系的静电势格点数据文件产生还需要什么步骤吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

22#
发表于 Post on 2025-5-16 04:07:47 | 只看该作者 Only view this author
红茶泡枸杞 发表于 2025-5-15 11:18
社长,我现在算个单点产生cube文件可以吗?周期性体系的静电势格点数据文件产生还需要什么步骤吗?

可以
Multiwfn创建CP2K输入文件的功能的界面里直接就可以选导出cube文件
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

100

帖子

0

威望

545

eV
积分
645

Level 4 (黑子)

23#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-16 11:33:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-16 04:07
可以
Multiwfn创建CP2K输入文件的功能的界面里直接就可以选导出cube文件
使用Multiwfn非常便利地创建CP ...

谢谢社长解答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 07:59 , Processed in 0.295800 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list