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[GROMACS] 请教使用Green-kubo方程计算黏度的问题

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查了些资料好多人用Lammps来计算黏度,目前我想用c++做编程,请问有没有人做过这面的工作,可以给出一点建议。

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发表于 Post on 2019-7-11 18:35:15 | 只看该作者 Only view this author
一些数值细节在此文里交代得比较充分,可以参考
Molecular Simulation, Vol. 33, No. 15, December 2007, 1261–1266
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2019-7-16 15:01:48 | 只看该作者 Only view this author
Reliable Viscosity Calculation from Equilibrium Molecular Dynamics Simulations: A Time Decomposition Method
DOI: 10.1021/acs.jctc.5b00351 J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 3537−3546
解释了这个公式以及实际应用中的一些问题,看他的参考文献可以很好的理解这一过程。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-26 09:21:17 | 只看该作者 Only view this author
Recycled 发表于 2019-7-16 15:01
Reliable Viscosity Calculation from Equilibrium Molecular Dynamics Simulations: A Time Decomposition ...

我还想请教您一下用G-K去计算的话,首先需要拟合一下压力与t的函数关系式对吗?这个有没么公式吗?

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发表于 Post on 2025-3-19 16:50:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-11 18:35
一些数值细节在此文里交代得比较充分,可以参考
Molecular Simulation, Vol. 33, No. 15, December 2007,  ...

老师有这篇文章的doi或者文章名称吗?我没有搜到

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发表于 Post on 2025-3-19 18:20:50 | 只看该作者 Only view this author
zhangfaxue 发表于 2025-3-19 16:50
老师有这篇文章的doi或者文章名称吗?我没有搜到

Google学术搜Molecular Simulation, 33, 1261 (2007)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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