antechamber 处理小分子出错

Lemon- · 发表于 Post on 2019-7-10 13:06:44

当处理小分子时，最后得到的.frcmod文件中，O-Cl-O键角为0，得到的.prepin的文件中信息不全，不知道哪里出了错，是因为氯比较特殊，所以有什么特殊的处理方法吗？试了好多次都没成功，求解答求解救，之前那个类似的贴子也看了，试了方法没有成功。http://bbs.keinsci.com/thread-6071-1-12.谢谢大家这个是报错信息：

这个是.perpin的信息：

这个是.frcmod的信息

sobereva · 发表于 Post on 2019-7-10 20:47:01

这种有机体系里不出现的成键方式没法自动指认恰当的参数，不要以为antechamber什么体系都能搞。
自己去拟合参数补进去

PS：不要在群里和论坛里24小时内问相同问题，群规和置顶的新人必读贴里都写明了

Lemon- · 发表于 Post on 2019-7-12 10:28:54

sobereva 发表于 2019-7-10 20:47
这种有机体系里不出现的成键方式没法自动指认恰当的参数，不要以为antechamber什么体系都能搞。
自己去拟 ...

好的谢谢老师那什么软件或者途径可以拟合参数吗？谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2019-7-13 05:11:38

Lemon- 发表于 2019-7-12 10:28
好的谢谢老师那什么软件或者途径可以拟合参数吗？谢谢老师

O-Cl-O用诸如Gaussian扫描个键角，然后用Origin一拟合就完了

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[Amber] antechamber 处理小分子出错

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