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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › PMF分析过程中的参数设置问题
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[GROMACS] PMF分析过程中的参数设置问题

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tianyongpan

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发表于 Post on 2019-5-24 18:31:59 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
做pmf分析，两部分之间属于弱相互作用，关于力常数、采样距离、pull_coord1_k的大小设定数值，问下有没有感觉什么标准？图片中力常数用的是8000，pull_coord1_k也是8000。都采用1000的情况，结构就跑散了，这8000结构没散，但是这图太诡异了，histo.xvg明显不合适

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