VASP跑MD的设置问题

15whyhq · 发表于 Post on 2019-3-9 13:38:58

本帖最后由 15whyhq 于 2019-3-9 23:24 编辑

看几个反应物（水分子，环氧化合物，过渡金属配合物催化剂，孤立体系）放一块会发生什么样的反应，用VASP跑MD合理吗？用VASP跑MD的一般过程是什么样的呢？
SMASS的值设为多少合适呢，也就是选用什么样的系综合适？

用VASP跑AIMD时的具体过程是什么，是直接在常温下进行NVT计算呢（跑一次）？还是高温平衡一段时间，再退火，退火完了还需要不需要常温平衡一段时间？还有高温平衡之前需要结构优化吗？
谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2019-3-9 16:39:31

先把体系具体特征描述清楚，都有什么物质、孤立体系还是周期性体系等等。要想得到准确的解答，前提是问题问得清楚明确

archer · 发表于 Post on 2019-3-9 17:45:32

催化剂是周期性的可以用VASP，但并不是一个好的选择，选用什么系综跟你想要模拟的情况有关啊，模拟反应一般NVT吧。

15whyhq · 发表于 Post on 2019-3-9 20:06:06

archer 发表于 2019-3-9 17:45
催化剂是周期性的可以用VASP，但并不是一个好的选择，选用什么系综跟你想要模拟的情况有关啊，模拟反应一般 ...

你好，谢谢你的回复，我想问下你，用VASP跑MD的一般过程是什么样的呢，分几步呢？第一步先让系统在高温下平衡一段时间，然后退火，这样可以吗？退火后还要平衡吗？

archer · 发表于 Post on 2019-3-10 00:09:46

15whyhq 发表于 2019-3-9 20:06
你好，谢谢你的回复，我想问下你，用VASP跑MD的一般过程是什么样的呢，分几步呢？第一步先让系统在高温下 ...

只跑过NVE系综。我觉得你先退火得到一些初始构型，然后跑NVT就行了。

sobereva · 发表于 Post on 2019-3-10 03:04:17

孤立体系用VASP跑MD明显不是好的选择，得设定较大真空区，这对于基于平面波的程序很浪费。Gaussian和ORCA跑孤立体系的MD明显更有效率，支持的理论方法更多，用着更方便，而且之后还能结合Multiwfn做各种各样的分析

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