计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7187|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] 求助:用phonopy从原胞扩展超胞时报错

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

248

eV
积分
267

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如图,想画声子谱,用phonopy扩展超胞的时候有如下报错。上网查了一下,说是局部变量冲突,想请大家帮忙看下这个问题出在哪,以及怎么解决。非常感谢!!


(base) [root@localhost Fe(SO4)]# phonopy -d --dim 2 2 2
        _
  _ __ | |__   ___  _ __   ___   _ __  _   _
| '_ \| '_ \ / _ \| '_ \ / _ \ | '_ \| | | |
| |_) | | | | (_) | | | | (_) || |_) | |_| |
| .__/|_| |_|\___/|_| |_|\___(_) .__/ \__, |
|_|                            |_|    |___/
                                       2.1.0

Traceback (most recent call last):
  File "/home/Conda/bin/phonopy", line 439, in <module>
    symprec=args.symprec)
  File "/home/Conda/lib/python3.7/site-packages/phonopy/cui/collect_cell_info.py", line 118, in collect_cell_info
    return "\n".join(msg_list)
UnboundLocalError: local variable 'msg_list' referenced before assignment
--------------------分割线--------------------------
以下是我的POSCAR文件,按理来说,问题不应该出在这吧。


Fe2 S3 O12
1.0
        8.2362003326         0.0000000000         0.0000000000
       -4.1181001663         7.1327587187         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        22.1786003113
   Fe    S    O
   12   18   72
Direct
     0.000000000         0.000000000         0.144109994
     0.000000000         0.000000000         0.855890036
     0.666666687         0.333333343         0.477443337
     0.666666687         0.333333343         0.189223334
     0.333333343         0.666666687         0.810776651
     0.333333343         0.666666687         0.522556663
     0.000000000         0.000000000         0.350699991
     0.000000000         0.000000000         0.649299979
     0.666666687         0.333333343         0.684033334
     0.666666687         0.333333343         0.982633352
     0.333333343         0.666666687         0.017366657
     0.333333343         0.666666687         0.315966666
     0.290439993         0.288179994         0.250719994
     0.709560037         0.711820006         0.749279976
     0.711820006         0.002260000         0.250719994
     0.288179994         0.997740030         0.749279976
     0.997740030         0.709560037         0.250719994
     0.002260000         0.290439993         0.749279976
     0.957106650         0.621513307         0.584053338
     0.376226664         0.045153338         0.082613342
     0.378486663         0.335593343         0.584053338
     0.954846680         0.331073344         0.082613342
     0.664406657         0.042893339         0.584053338
     0.668926656         0.623773336         0.082613342
     0.623773336         0.954846680         0.917386651
     0.042893339         0.378486663         0.415946662
     0.045153338         0.668926656         0.917386651
     0.621513307         0.664406657         0.415946662
     0.331073344         0.376226664         0.917386651
     0.335593343         0.957106650         0.415946662
     0.194299996         0.204799995         0.193820000
     0.805700004         0.795199990         0.806180000
     0.795199990         0.989499986         0.193820000
     0.204799995         0.010499999         0.806180000
     0.010499999         0.805700004         0.193820000
     0.989499986         0.194299996         0.806180000
     0.860966682         0.538133323         0.527153313
     0.472366661         0.128533334         0.139513329
     0.461866677         0.322833329         0.527153313
     0.871466637         0.343833327         0.139513329
     0.677166641         0.139033332         0.527153313
     0.656166673         0.527633309         0.139513329
     0.527633309         0.871466637         0.860486686
     0.139033332         0.461866677         0.472846657
     0.128533334         0.656166673         0.860486686
     0.538133323         0.677166641         0.472846657
     0.343833327         0.472366661         0.860486686
     0.322833329         0.860966682         0.472846657
     0.224000007         0.145600006         0.298429996
     0.776000023         0.854399979         0.701570034
     0.854399979         0.078400001         0.298429996
     0.145600006         0.921599984         0.701570034
     0.921599984         0.776000023         0.298429996
     0.078400001         0.224000007         0.701570034
     0.890666664         0.478933334         0.631763339
     0.442666650         0.187733322         0.034903336
     0.521066666         0.411733329         0.631763339
     0.812266648         0.254933327         0.034903336
     0.588266671         0.109333329         0.631763339
     0.745066643         0.557333350         0.034903336
     0.557333350         0.812266648         0.965096653
     0.109333329         0.521066666         0.368236661
     0.187733322         0.745066643         0.965096653
     0.478933334         0.588266671         0.368236661
     0.254933327         0.442666650         0.965096653
     0.411733329         0.890666664         0.368236661
     0.492199987         0.363400012         0.243579999
     0.507799983         0.636600018         0.756420016
     0.636600018         0.128799975         0.243579999
     0.363400012         0.871200025         0.756420016
     0.871200025         0.507799983         0.243579999
     0.128799975         0.492199987         0.756420016
     0.158866659         0.696733356         0.576913357
     0.174466684         0.969933331         0.089753337
     0.303266644         0.462133318         0.576913357
     0.030066678         0.204533353         0.089753337
     0.537866712         0.841133356         0.576913357
     0.795466661         0.825533330         0.089753337
     0.825533330         0.030066678         0.910246670
     0.841133356         0.303266644         0.423086673
     0.969933331         0.795466661         0.910246670
     0.696733356         0.537866712         0.423086673
     0.204533353         0.174466684         0.910246670
     0.462133318         0.158866659         0.423086673
     0.252700001         0.439300001         0.265899986
     0.747300029         0.560699999         0.734099984
     0.560699999         0.813400030         0.265899986
     0.439300001         0.186600000         0.734099984
     0.186600000         0.747300029         0.265899986
     0.813400030         0.252700001         0.734099984
     0.919366658         0.772633314         0.599233329
     0.413966656         0.894033313         0.067433350
     0.227366671         0.146733329         0.599233329
     0.105966665         0.519933343         0.067433350
     0.853266656         0.080633335         0.599233329
     0.480066657         0.586033344         0.067433350
     0.586033344         0.105966665         0.932566643
     0.080633335         0.227366671         0.400766671
     0.894033313         0.480066657         0.932566643
     0.772633314         0.853266656         0.400766671
     0.519933343         0.413966656         0.932566643
     0.146733329         0.919366658         0.400766671



本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 20:33 , Processed in 0.432230 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list