计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10839|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CASTEP/Dmol3/MS] 通过态密度是否能判断新键的生成

[复制链接 Copy URL]

104

帖子

0

威望

1502

eV
积分
1606

Level 5 (御坂)

请问老师,通过md前后PDOS图的变化,能否可以说明N-O键的断裂,Al-O键的生成呢?

q N1 rdxO1.JPG (90.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

md之前N-O

md之前N-O

N1 rdxO1.JPG (79.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 48)

md之后N-O

md之后N-O

q al rdxO1.JPG (67.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

md之前Al-O

md之前Al-O

al rdxO1.JPG (67.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

md之后Al-O

md之后Al-O

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120159

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-11-20 10:37:45 | 只看该作者 Only view this author
通过PDOS来考察太过于间接
直接观看轨迹,看原子间的距离改变,都比用这个判断更好。PDOS本身也不直接体现空间位置信息,但显然成键的前提是空间距离足够近
更直接的判断是看原子间对应的OPDOS
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

104

帖子

0

威望

1502

eV
积分
1606

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-20 11:30:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-20 10:37
通过PDOS来考察太过于间接
直接观看轨迹,看原子间的距离改变,都比用这个判断更好。PDOS本身也不直接体现 ...

老师,原子间对应的OPDOS是指?
怎样实现呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120159

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2018-11-20 11:32:19 | 只看该作者 Only view this author
CocuLiu 发表于 2018-11-20 11:30
老师,原子间对应的OPDOS是指?
怎样实现呢?

OPDOS=overlap population DOS
Multiwfn原文J. Comput. Chem., 33, 580 (2012)里就有介绍
M$我用的少,具体操作不知道

这篇文章也推荐你读读,虽然具体程序实现上和你当前的问题差异大,但是对理解此问题有帮助
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

104

帖子

0

威望

1502

eV
积分
1606

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-20 11:50:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-20 11:32
OPDOS=overlap population DOS
Multiwfn原文J. Comput. Chem., 33, 580 (2012)里就有介绍
M$我用的少, ...

谢谢老师。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 13:50 , Processed in 0.459641 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list