关于gromacs的gmx freevolume功能的选区问题

zdwssg123 · 发表于 Post on 2018-5-18 15:23:25

我的体系是一个表面活性剂的界面体系，我想计算表面活性剂层的自由体积，打算使用gmx freevolume这个程序，但是这个函数计算的结果是整个盒子的自由体积，请问大神们，我可以通过什么选项来选定表面活性剂层呢，可以用-select吗，具体怎么使用呢？求大神解答！！！！谢谢!

ruanyang · 发表于 Post on 2018-5-19 20:08:04

你确定gmx freevolume 不能选择group
-n [<.ndx>] (index.ndx) (Input, Optional)
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[GROMACS] 关于gromacs的gmx freevolume功能的选区问题