|
需要更多的Q（156449799，备注JH） 安装步骤： 1、安装ifort、icc： #mount TLF-SOFT-Intel.Cluster.Toolkit.Compiler.Edition.3.2.1.015.LINUX-SPYRAL.iso /mnt -o loop（ifort的iso文件） #cd /mnt/ #./install.sh #vi /etc/profile写入： source /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/iccvars.sh intel64 source /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/ifortvars.sh intel64
2、安装openmpi （新CPU一定要用最新版本的openmpi） #mkdir /opt/openmpi # ./configure --prefix=/opt/openmpi CC=icc FC=ifort CXX=icpc --enable-mpi-fortran #make #make install #vi /etc/profile写人： export MPI_HOME=/opt/openmpi export PATH=$MPI_HOME/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH
3、安装fftw: #mkdir /opt/fftw #./configure --prefix=/opt/fftw CC=gcc MPICC=mpicc FC=ifort F77=ifort --enable-mpi --enable-openmp --enable-threads --enable-avx #make #make install
4、安装vasp.5.lib #cp makefile.linux_ifc_P4 makefile #vi makefile修改： CPP = icc -E -P -C $*.F >$*.f FC=ifort #make
5、修改makfile.include # 修改 makefile.include 文件 cp ./arch/makefile.include.linux_intel ../makefile.include # 备注：该步骤为主要修改部分，请仔细修改。 vim makefile.include
将： FC = mpiifort FCL = mpiifort -mkl 修改为： FC = mpif90 FCL = mpif90 -mkl 说明： 默认是使用intel的mpi，即为mpiifort。但是如果使用的是例如mpich/openmpi的话，那么需要修改为mpif90。
OFLAG=-O3 -ip
将：BLACS = -lmkl_blacs_openmpi_lp64 修改为：BLACS = -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 说明： 检查BLACS ，如果默认就是 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64则不需要修改（针对impi及mpich等）；如果使用openmpi的时候则需要设置为 -lmkl_blacs_openmpi_lp64。
将：OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o $(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a 修改为：OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o /opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mkl/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a 说明： 如果是在安装intel compiler后手动编译了libfftw3xf_intel.a 则不需要修改，否则它会找不到这个fftw库。 我们需要手动编译这个库，并把“/path/to”设置为实际的路径。
编译vasp 现在可以开始编译vasp了，默认情况下，可以选择： make all
这样可以在编译后生成三个可执行文件，如下： vasp_std 默认版本 vasp_ncl 支持自旋轨道耦合的版本 vasp_gam 支持gamma的版本。
6、把vasp.5.4/bin里的vasp_std拷贝到/usr/bin目录下：cp vasp_std /usr/bin（或者cp vasp_std /usr/bin/vasp，这样就可以输入vasp运行）
7、Vi /etc/profile写入： ulimit -s unlimited
作业测试： 在作业目录下，输入：mpirun -np 36 vasp_std（或vasp） > out& （36为核数） 如果能正常运行，则为安装成功。
| 
发表于 Post on 2018-1-26 11:24:01
收藏 Add to favorites