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[GROMACS] gmx_MMPBSA报错UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode

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楼主
我在linux的机子上安装了gmx_MMPBSA,gmx_MMPBSA -O -i pmf.in -cs umbrella20.tpr -ci 3.ndx -ct umbrella20.xtc -cp topol.top -o result.dat -cg 9 10使用这个指令后始终报错UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xc5 in position 280: invalid continuation byte,Exiting. All files have been retained.
改为-cg 0 1就会报错体系中存在水分子(我知道计算的时候不能有水,尝试一下),index中9和10group是使用gmx make_ndx后自己加的,0 1就是system和water。想问一下这是什么原因,是我软件编译的问题吗



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-16 11:39:43 | 只看该作者 Only view this author
已解决,把拓扑文件转码一下即可

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