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[Lammps] reaxff力场优化/校验/建模的学习方法的意见咨询

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各位大佬好!
我目前完成了lammps和reaxff的入门部分,对于lammps我掌握了in文件的六大模块,并且观看了bly老师的教程。知道了moltemplate,分子模板,packmol,聚合物建模等建模方法。
  对于reaxff我明白了其data文件,知道了使用Avogadro也可以得到data文件。同时学习了力场验证部分的内容,也学习了力场优化部分的流程和需要使用的garfield软件以及四个文件。
  我目前的主要困境是我没有关于力场优化的例子,也没有力场优化的完整教程。同时自己对于力场的选择只知道至少反应体系的元素要基本上在力场内,对于多个力场文件合并也没有看过具体操作。对于力场模型的验证我不知道如何选择键和键角等。对于data文件我不知道其和lammps的几种建模方法得到的data的区别以及是否能用这几种方法。对于力场的优化我也不知道如何去选择优化的参数,对于验证的结果不知道有没有可以快速可视化的代码。现在手边没有教程和例子我也不知道接下来具体该如何去提高这方面的能力。

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发表于 Post on 2025-3-13 14:53:47 | 只看该作者 Only view this author
力场优化好做吗?感觉有点困难吧 好像资料确实不多

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-13 21:46:55 | 只看该作者 Only view this author
不太清楚我也是刚刚入门所以来论坛问问,我对立场了解不够多,现在也不太清楚怎么找力场

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发表于 Post on 2025-3-14 04:36:07 | 只看该作者 Only view this author
必须先学量子化学计算的基础,通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)可以快速上手,然后用合理的量子化学计算级别和reaxFF计算被研究的反应的关键坐标上的势能曲线,以此检验力场的合理性。例如如果跑水+硅晶面的reaxFF的动力学模拟,可以像下图这样计算反应路径上的各个驻点的能量进行对比来验证。当前就算对得不错。顺带一提,量子化学程序如Gaussian适合用图中这样的簇模型算,而如果通过北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)学CP2K,则可以直接用周期性模型算,更方便且可以理想考虑周期性。



如果发现reaxFF的误差大而需要优化参数,先把力场函数形式搞得非常清楚(看原文和综述),然后自己定义误差函数F({x})通过优化力场参数{x}去减小误差,需要学一些非线型优化的数值算法方面的知识(比如《无需导数的局部极小化算法NEWUOA在Fortran中的使用简例》http://sobereva.com/536、《L-BFGS-B局部极小化算法在Fortran中的使用简例》http://sobereva.com/538)。优化力场参数的文章多的是,花点时间搜索,有的是可以参考的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-14 11:14:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-14 04:36
必须先学量子化学计算的基础,通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)可以快速上 ...

多谢大佬答疑解惑。所以后续对于优化力场的方法主要是研究论文学习,对于力场验证和data文件建立方面通过学习例子可以提升吗北京科音初级量子化学培训班我打算看看能不能购买往届回放视频

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-14 13:48:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-14 04:36
必须先学量子化学计算的基础,通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)可以快速上 ...

那大佬,我看您们科音这边有很多培训班,对于我这种希望用reaxff进行热解模拟,后续可能和chemkin结合的初学者来说,主要是先学习量子化学的初级中级高级三个班吗

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发表于 Post on 2025-3-14 14:51:35 | 只看该作者 Only view this author
55661122 发表于 2025-3-14 13:48
那大佬,我看您们科音这边有很多培训班,对于我这种希望用reaxff进行热解模拟,后续可能和chemkin结合的 ...

先把下文认真看一遍。没有什么所谓的往届视频,只有购买往届资料,等于同不到场参加往届培训
北京科音办的培训班FAQ
http://www.keinsci.com/FAQ.html

你若要自己搞力场,最最起码得有北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)程度的量子化学知识和计算技能,再把中级班学了能做得明显更好。若要做复杂体系很高精度力场则可能需要涉及高级班里的知识。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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