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[VMD] 求助:vmd如何计算配体受体复合物和配体的rmsd

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想问一下vmd中依次输入复合物和配体的pdb文件,是否可以计算复合物中相应的配体部分和单独配体的rmsd。

复合物残基序号:配体部分:430-443;
单独配体残基序号:1-14。

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2#
发表于 Post on 2024-5-8 06:17:15 | 只看该作者 Only view this author
VMD自带的RMSD Trajectory tool插件里写上恰当的选择语句就完了

VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

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