使用pdb2gmx提示错误gmx: command not found

王寓于 · 发表于 Post on 2020-3-2 17:08:06

第一次使用gromacs，按照教程在使用gmx pdb2gmx -f 1aki.pdb -o 1aki.gro -water spce 命令以后不是应该会提示我选择立场吗？为什么我输入以后会提示如图所示的错误？请问命令里gmx哪里出错了？

wuzhiyi · 发表于 Post on 2020-3-2 17:59:17

module show gromacs
然后看prepend-path里的bin里面的gromacs叫什么大概率叫gmx_mpi

Alan123 · 发表于 Post on 2020-3-2 19:37:22

which gmx和which gmx_mpi，看看哪个命令是存在的？如果都没有，可能就是你安装的问题了，没有安装成功

王寓于 · 发表于 Post on 2020-3-2 19:48:48

wuzhiyi 发表于 2020-3-2 17:59
module show gromacs
然后看prepend-path里的bin里面的gromacs叫什么大概率叫gmx_mpi

非常感谢。

Anaaa · 发表于 Post on 2024-4-16 16:51:47

感谢

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[GROMACS] 使用pdb2gmx提示错误gmx: command not found