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[GROMACS] 为什么tau_p要大于tau_t两倍啊?

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楼主
为什么 tau_p要大于tau_t两倍啊
我在GROMACS 5.1的时候不需要这样,但是用GROMACS 2019.4需要这样

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发表于 Post on 2020-3-22 14:22:59 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的不恰当标题“GROMACS基本知识求助”改了,以后务必注意

并没有这个强制要求,你可以无视警告。程序对这点进行吐槽记得大抵是为了出现类似共振的效应。正常的设定一般也不会触犯这个槽点,诸如通常PR压浴tau_p我用2 ps,V-rescale热浴tau_t我用0.2 ps。
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发表于 Post on 2025-2-9 15:38:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-22 14:22
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs ...

请问sob老师,使用C-rescale控压时候,tau_p应该设置为多少?

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喵星人

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发表于 Post on 2025-2-10 02:17:22 | 只看该作者 Only view this author
youknowdcf 发表于 2025-2-9 15:38
请问sob老师,使用C-rescale控压时候,tau_p应该设置为多少?

0.5-2ps

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发表于 Post on 2025-2-10 08:25:10 | 只看该作者 Only view this author

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