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[Lammps] 提问:石墨烯表面加入羰基,opls力场适合用来描述羰基吗?

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老师们好
      1、我做的有机质吸附,在做石墨烯两相吸附时,石墨烯壁面加入含氧官能团羰基,opls力场我知道是适合有机质的,但是加入羰基后没找到opls力场没找到合适的势参数,所以请教一下opls力场能用来描述带羰基的石墨烯壁面吗?不行的话我就要考虑换其他力场。
      2、请问各位老师,带含氧官能团羰基的石墨烯壁面做吸附模拟,有推荐的力场吗?

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发表于 Post on 2022-11-23 00:24:26 | 只看该作者 Only view this author
OPLS-AA、GAFF等普通有机力场不会恰好有专门适合的参数描述这种情况
这类偏离普通有机体系显著的情况,可以用Gaussian、ORCA对带羰基的石墨烯片段做优化和振动分析,结合sobtop(http://sobereva.com/soft/Sobtop#)去得到适合的力场参数(平衡键长键角二面角、力常数)。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-23 11:07:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-23 00:24
OPLS-AA、GAFF等普通有机力场不会恰好有专门适合的参数描述这种情况
这类偏离普通有机体系显著的情况,可 ...

好的 谢谢社长!我去试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-23 19:31:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-23 00:24
OPLS-AA、GAFF等普通有机力场不会恰好有专门适合的参数描述这种情况
这类偏离普通有机体系显著的情况,可 ...

社长,请问一下ligpargen可以得到opls力场中羰基适合的力场参数吗

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发表于 Post on 2022-11-24 00:59:43 | 只看该作者 Only view this author
WAyue 发表于 2022-11-23 19:31
社长,请问一下ligpargen可以得到opls力场中羰基适合的力场参数吗

没法像sobtop一样针对具体化学环境基于Hessian计算出参数,而只能指认库里的参数,没有正好专门适合石墨烯上的羰基的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-24 09:12:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-24 00:59
没法像sobtop一样针对具体化学环境基于Hessian计算出参数,而只能指认库里的参数,没有正好专门适合石墨 ...

好的 感谢社长答复

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