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[CASTEP/Dmol3/MS] DMol3 寻找过渡态问题

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老师好,我在Dmol3跑完动力学之后,在轨迹文件(.xtd)中选取了中间的两个结构(两个结构并不连续),分别作为反应物和生成物进行优化,再进行寻找过渡态。但是一直出现图中的错误。希望老师给我指导一下。谢谢您!

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发表于 Post on 2018-11-26 16:53:56 | 只看该作者 Only view this author
或许两个结构不是基元反应对应的两端的结构
可以用找过渡态好得多的Gaussian找出来过渡态,再用dmol3想办法重现
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-26 16:58:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-26 16:53
或许两个结构不是基元反应对应的两端的结构
可以用找过渡态好得多的Gaussian找出来过渡态,再用dmol3想办 ...

老师,之前用高斯做过,但是涉及到三聚体时,高斯计算太慢了,而且报错。
后来才改用Dmol3,想着跑完MD之后,根据轨迹的变化来确定一个范围,再来寻找过渡态。

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发表于 Post on 2018-11-26 17:07:31 | 只看该作者 Only view this author
CocuLiu 发表于 2018-11-26 16:58
老师,之前用高斯做过,但是涉及到三聚体时,高斯计算太慢了,而且报错。
后来才改用Dmol3,想着跑完MD ...

嫌Gaussian慢一定是没有正确用对计算方式
杂化泛函Gaussian速度吊打Dmol3。论纯泛函,ORCA开RI速度吊打Dmol3。Dmol3在找过渡态方面什么都不是,找过渡态算法方面Gaussian甩Dmol3几条街。
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