求助：分子动力学下不同温度运算出的密度数据不合理应该如何解决

zzzzvoid · 发表于 Post on 2021-7-6 15:57:53

对搭建的超晶胞进行退火后运算NPT系综下的分子动力学得出的密度和设置温度参数如下表压强相同的情况下随着温度的升高密度不断降低
但273K下的密度为1.805 与下降趋势不符

问：应该怎么合理解释这种现象？是否需要重新计算273k的分子动力学直至密度符合下降趋势？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-6 16:21:14

表没有贴上来。
一般大部分物质的密度都随温度升高而降低吧，你指的是密度随温度变化的趋势不合理，还是某个特定温度下的密度太大/太小？后者可能只是力场的系统误差，但如果是前者，问题就比较大了

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-7 09:09:32

看273 K以上和以下物质状态有无明显变化

出现相变的时候可能令密度突然波动

zzzzvoid · 发表于 Post on 2021-7-7 09:27:10

表格如上可以看出203k升温至273K 密度不断降低在303K时密度突然升高升温至323K后密度又符合下降趋势

zzzzvoid · 发表于 Post on 2021-7-7 09:28:03

wzkchem5 发表于 2021-7-6 16:21
表没有贴上来。
一般大部分物质的密度都随温度升高而降低吧，你指的是密度随温度变化的趋势不合理，还是某 ...

不好意思帖子现在传上来了麻烦您再帮看一下谢谢

zzzzvoid · 发表于 Post on 2021-7-7 09:41:09

sobereva 发表于 2021-7-7 09:09
看273 K以上和以下物质状态有无明显变化

出现相变的时候可能令密度突然波动

sober老师我使用material studio 跑的搭建的超晶胞的分子动力学 ms能否在计算时考虑到物质的相变么
表格刚传到下一楼了麻烦老师再帮看一下

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-8 12:39:53

zzzzvoid 发表于 2021-7-7 09:41
sober老师我使用material studio 跑的搭建的超晶胞的分子动力学 ms能否在计算时考虑到物质的相变么
表 ...

不是计算时候是否考虑相变，而是在特定模拟条件下，如果本来会发生相变，就会自然而然出现

你可以在273~323之间再多考虑几个温度跑跑

zzzzvoid · 发表于 Post on 2021-7-8 16:24:38

sobereva 发表于 2021-7-8 12:39
不是计算时候是否考虑相变，而是在特定模拟条件下，如果本来会发生相变，就会自然而然出现

你可以在27 ...

好的谢谢sober老师我再多跑几个温度

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