铁酸钴（三维）与石墨碳（二维）吸附PMS相关吸附能力对比，盒子参数如何设置？

洛川i

铁酸钴为三维模型，盒子真空层为20埃，盒子为正棱柱形，具体参数见图。
石墨碳为二维模型，盒子为菱形棱柱，石墨碳在Z轴上没有数值，那么石墨碳盒子如果设置和铁酸钴盒子参数一致，那么石墨碳的真空层就不是20埃，不知道怎么设置了。
此外两者的盒子形状不完全一致，有必要把石墨碳结构的盒子转换为正棱柱行么？我看的是不能随意转换的。

洛川i

此外我也想过建立双层石墨结构，但双层石墨结构之间的间距是3.4埃，铁酸钴模型第一层到第四层的距离为4.68埃，也是不一致的。