在ubuntu中用lammps跑反应，一直卡在某一步长，但cpu显示该进程还在运行，如何解决？

njustwjy · 发表于 Post on 2022-5-10 13:41:37

我在ubuntu中用lammps的reaxFF力场跑铝粉的氧化反应，用8核并行计算，一直卡在1016500步不动（一整天了，不是因为计算慢而没有显示），但后台的cpu进程显示其还在运行，我又看了log文件，发现log文件输出的信息也在1016500不动，请问这种情况该如何解决？谢谢。

abin · 发表于 Post on 2022-5-11 08:06:09

用我提供的版本试试？
盲猜，MPI问题。

其他信息看签名链接🔗。

njustwjy · 发表于 Post on 2022-5-11 09:35:30

abin 发表于 2022-5-11 08:06
用我提供的版本试试？
盲猜，MPI问题。

谢谢您的回复，我现在这个任务还没关，还是这个步数，我打开监视器，发现这个任务还在占用内存，还在占用cpu，太奇怪了，就是不输出数据。

mengxiangidea · 发表于 Post on 2022-5-11 10:58:07

跑reaxff，一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。

njustwjy · 发表于 Post on 2022-5-11 17:29:41

mengxiangidea 发表于 2022-5-11 10:58
跑reaxff，一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。

谢谢您的建议。

nickfaker · 发表于 Post on 2024-9-24 20:47:55

请问楼主解决这个问题了吗？我在服务器上跑reax也出现了这个问题，一直在运行没有输出。但是我自己电脑跑却没有问题

lhl161820 · 发表于 Post on 2024-12-30 17:06:57

nickfaker 发表于 2024-9-24 20:47
请问楼主解决这个问题了吗？我在服务器上跑reax也出现了这个问题，一直在运行没有输出。但是我自己电脑跑却 ...

请问解决了么，我在服务器上跑reax也是这个问题，一直在跑，log文件上显示没输出，但是轨迹文件的步数一直在加，是显示问题么，还是这样会一直跑下去

1170356417 · 发表于 Post on 2025-4-11 11:04:44

我在超算上跑reaxff也遇到同样的问题，请问最后是怎么解决的?

1170356417 · 发表于 Post on 2025-4-11 11:06:05

abin 发表于 2022-5-11 08:06
用我提供的版本试试？
盲猜，MPI问题。

我也遇到了同样的问题，请问是并行的问题吗？有解决方案吗？

1170356417 · 发表于 Post on 2025-4-11 11:06:44

mengxiangidea 发表于 2022-5-11 10:58
跑reaxff，一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。

请问reaxff包怎么打开

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