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[GROMACS] 求助:使用trr轨迹转换程序trr2all程序出现报错

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在使用李老师trr轨迹转换程序trr2all,命令为:.\trr2all -f md.trr -s md.tpr -n index.ndx -g Sytem -o traj.trr -oqv -gmx gmx后时,提示:Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.并且所得文件大小为0kb

屏幕截图 2025-04-17 153808.png (50.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

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发表于 Post on 2025-4-17 15:52:18 | 只看该作者 Only view this author
根据提示理解可能原因
rm是linux下的命令,显然应该在Linux或类Linux(如cmder模拟的Bash)环境下运行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-17 16:27:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-17 15:52
根据提示理解可能原因
rm是linux下的命令,显然应该在Linux或类Linux(如cmder模拟的Bash)环境下运行

sob老师,您的意思是,运行环境错误导致报错Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.吗?

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发表于 Post on 2025-4-17 16:36:01 | 只看该作者 Only view this author
Z_v 发表于 2025-4-17 16:27
sob老师,您的意思是,运行环境错误导致报错Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - inv ...

我完全没听说过这个程序,也不知道你要拿它干嘛(也很可能有其它的更好的选择),我只能根据你屏幕上的显而易见的报错提示,让你先解决最显而易见的问题。之后再说其它的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-17 16:45:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-17 16:36
我完全没听说过这个程序,也不知道你要拿它干嘛(也很可能有其它的更好的选择),我只能根据你屏幕上的显 ...

好的,我试一下。谢谢sob老师

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