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[GROMACS] 关于非极分子体系能量分组算静电能

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本帖最后由 关于时间DE 于 2025-3-2 21:26 编辑

体系环境为非极性烷烃分子,盒子里还放了一个带有极性基团和长碳侧链的分子,请问能量分组rerun后算出来静电能是负的正常吗,是负的意味着是静电能起吸引作用

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发表于 Post on 2025-3-5 06:53:35 | 只看该作者 Only view this author
没有必然异常
非极性分子也不代表原子电荷就都是0
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