Dmol3模拟表面吸附问题

卡西特 · 发表于 Post on 2019-4-24 14:24:03

利用Dmol3 模块模拟氧气在空位缺陷二氧化锡表面吸附问题，文献中给出的结构中氧分子会与表面的原子发生键合，但是我照着给出的参数进行模拟，始终得不到相同的结,向请教下，对于气体在表面吸附，一般是结构优化完之后，若有键合，是直接出现在模型视图中，还是要进行其他操作？

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-24 21:53:56

到底是castep 还是dmol3？标题和叙述不一致
优化完了，自然成键的原子间距离就显著缩短了，直接从图上就能看得出来

卡西特 · 发表于 Post on 2019-4-25 08:59:50

写错了，是Dmol3模块，距离变短，还是不会显现键合，还是的有其操作，看别人的贴子，是通过 build-bonds-calculate bonds,显现的，展示还不清楚其合理性

卡西特 · 发表于 Post on 2019-4-25 09:05:43

sobereva 发表于 2019-4-24 21:53
到底是castep 还是dmol3？标题和叙述不一致
优化完了，自然成键的原子间距离就显著缩短了，直接从图上就能 ...

还想问老师一个问题，就是一般来说吸附能越大的模型更稳定，但是有成键反应的优先考虑，有点疑惑的是有成键反应的吸附模型，其吸附能却比无成键反应的吸附模型更小，请问这是否合理

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-25 12:20:37

卡西特发表于 2019-4-25 08:59
写错了，是Dmol3模块，距离变短，还是不会显现键合，还是的有其操作，看别人的贴子，是通过 build-bonds-ca ...

那只不过是根据半径来判断键连关系
看此文了解相关知识
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

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