金属核壳模型如何建模？

yaoyaoy · 发表于 Post on 2018-10-15 20:35:45

请问各位老师，下图这种表面几层是铂，里面是铂和其他金属的合金的核壳模型，如何在VESTA或者MS等软件里建模呢？

coolrainbow · 发表于 Post on 2018-10-15 23:04:07

ABCluster非常适合这个工作。通过力场构造各种金属的合金团簇

ABCluster可见 http://www.zhjun-sci.com/software-abcluster-download.php

sobereva · 发表于 Post on 2018-10-16 01:00:34

用VMD的选择语句非常简单就能构建，诸如先把金属的一个很大的复晶胞结构文件载入进去，用诸如sqr(x-5)+sqr(y+4)+sqr(z) < sqr(5)可以选择以(5, -4, 0)点为中心半径5埃以内的原子。把半径再扩大，就可以选出更大范围的球。还可以比如用 {选择语句1} and not {选择语句2} 形式，来选择两个半径之间球层原子（即一个壳层）。选择的范围可以导出成各种常见结构文件格式。

yaoyaoy · 发表于 Post on 2018-10-16 09:33:49

coolrainbow 发表于 2018-10-15 23:04
ABCluster非常适合这个工作。通过力场构造各种金属的合金团簇

谢谢回复！又认识了一个新的软件。

yaoyaoy · 发表于 Post on 2018-10-16 09:38:33

sobereva 发表于 2018-10-16 01:00
用VMD的选择语句非常简单就能构建，诸如先把金属的一个很大的复晶胞结构文件载入进去，用诸如sqr(x-5)+sqr( ...

谢谢Sob的解答，很详细，非常感谢。根据您说的，我想再问个问题，如果想在这个模型上切割出不同的晶面，是不是调整您说的这个半径的值呢？

sobereva · 发表于 Post on 2018-10-16 09:40:21

yaoyaoy 发表于 2018-10-16 09:38
谢谢Sob的解答，很详细，非常感谢。根据您说的，我想再问个问题，如果想在这个模型上切割出不同的晶面， ...

靠改半径没法实现
可以在VMD里用数学表达式设定某个平面以上或以下的原子被去除

yaoyaoy · 发表于 Post on 2018-10-16 09:42:17

sobereva 发表于 2018-10-16 09:40
靠改半径没法实现
可以在VMD里用数学表达式设定某个平面以上或以下的原子被去除

嗯嗯，学习了，谢谢。

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