计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8577|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] nwchem输出的.cube文件

[复制链接 Copy URL]

60

帖子

0

威望

848

eV
积分
908

Level 4 (黑子)

请教sob老师,想做一个电子密度差图(双电荷减去单电荷),用nwchem产生了电子密度的cube文件,按照您手册的步骤,在用multiwfn算电子密度差图时,屏幕没有电子密度这一选项,请问这是怎么回事呢,谢谢。

electrondensity.png (16.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

electrondensity.png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120192

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-1-12 12:38:43 | 只看该作者 Only view this author
cube文件里不含波函数信息,显然没法计算电子密度,获得密度差。
cube里仅有格点数据和原子坐标信息,顶多通过两个含有密度格点数据的cube文件用multiwfn主功能13里的格点运算功能求差。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

60

帖子

0

威望

848

eV
积分
908

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-12 14:28:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-12 12:38
cube文件里不含波函数信息,显然没法计算电子密度,获得密度差。
cube里仅有格点数据和原子坐标信息,顶多 ...

谢谢sob老师,nwchem如何产生波函数,从而计算密度差呢,谢谢

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120192

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2018-1-14 21:35:55 | 只看该作者 Only view this author
lianghua飘 发表于 2018-1-12 14:28
谢谢sob老师,nwchem如何产生波函数,从而计算密度差呢,谢谢

目前没有简单的办法。
目前最新版NWChem (6.8)虽然支持输出.molden文件,但是内容严重不标准,虽然能被Multiwfn读取,但结果是错的
利用JANPA程序自带的工具也能把nwchem的波函数信息转换成.molden文件形式,但用起来比较麻烦,而且也未必能被Multiwfn正常载入。
简单来说建议换个程序。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 01:54 , Processed in 0.151851 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list