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[NAMD] 关于施加渗透压的问题

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我想对环肽纳米管的两侧的水分子施加渗透压,有tcl force 和tcl bc l两种方式,但我用tcl force 算提示错误 ,我用的脚本如下 ,不知道该怎么改呢?另外怎么用tcl bc施加渗透压呢?

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发表于 Post on 2017-9-25 22:09:23 | 只看该作者 Only view this author
建议查看NAMD官网上教程Simulation of Water Permeation Through Nanotubes 这上面有相关的case可以学习

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-26 09:46:34 | 只看该作者 Only view this author
感谢回复,这个脚本是我看了Simulation of Water Permeation Through Nanotubes后修改成的,可是他跑npt的时候出现错误
can't use non-numeric floating-point value as operand of "/"
    while executing
"expr $z-round($z/$cellLengthZ)*$cellLengthZ"
    (procedure "calcforces" line 6)
    invoked from within
"calcforces"
请问脚本中的这一行怎么修改呢?

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