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[NBO相关] NBO软件win怎么用

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老师,NBO软件win怎么用

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发表于 Post on 2016-11-18 05:11:44 | 只看该作者 Only view this author
NBO一种是直接由量化程序调用的,高斯自带的L607模块就属于这种。还一种是可以独立运行的,叫做GENNBO,运行方便,GENNBO 5.0、6.0在论坛里就有
用Gaussian之类程序产生.47文件,这是GENNBO的输入文件,然后用GENNBO载入.47文件就可以计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-12-13 16:00:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-11-18 05:11
NBO一种是直接由量化程序调用的,高斯自带的L607模块就属于这种。还一种是可以独立运行的,叫做GENNBO,运 ...

高斯计算结果
Summary of Natural Population Analysis:                  
                                                         
                                       Natural Population
                Natural  -----------------------------------------------
    Atom  No    Charge         Core      Valence    Rydberg      Total
-----------------------------------------------------------------------
      N    1   -0.80841      1.99906     5.77366    0.03569     7.80841
      C    2    0.88733      1.99932     3.08245    0.03091     5.11267
      O    3   -0.44141      1.99972     6.41175    0.02993     8.44141
      S    4    1.17191      9.99906     4.70153    0.12750    14.82809
      O    5   -0.80942      1.99984     6.75390    0.05568     8.80942
=======================================================================
   * Total *    0.00000     17.99700    26.72329    0.27971    45.00000

高斯产生.47再用NBO5计算结果
Summary of Natural Population Analysis:

                                     Natural Population                 Natural
             Natural    ---------------------------------------------    Spin
  Atom No    Charge        Core      Valence    Rydberg      Total      Density
------------------------------------------------------------------------------
    N  1   -0.80891      1.99905     5.77330    0.03655     7.80891    -0.00702
    C  2    0.88187      1.99932     3.08081    0.03800     5.11813     0.05158
    O  3   -0.43770      1.99972     6.41224    0.02574     8.43770     0.04996
    S  4    1.17192      9.99906     4.70115    0.12787    14.82808     0.56343
    O  5   -0.80719      1.99984     6.75456    0.05278     8.80719     0.34205
===============================================================================
* Total *  0.00000     17.99699    26.72207    0.28094    45.00000     1.00000

计算结果基本没区别啊?这样NBO5计算就没意义啊

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发表于 Post on 2016-12-13 23:24:58 | 只看该作者 Only view this author
那丢失的 发表于 2016-12-13 16:00
高斯计算结果
Summary of Natural Population Analysis:                  
                          ...


有的有区别,有的没区别
如果所有都有明显区别,NBO3.1岂不没人敢用了?
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发表于 Post on 2016-12-14 08:18:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-13 23:24
有的有区别,有的没区别
如果所有都有明显区别,NBO3.1岂不没人敢用了?

谢谢Sob老师!

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发表于 Post on 2017-8-4 10:45:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-13 23:24
有的有区别,有的没区别
如果所有都有明显区别,NBO3.1岂不没人敢用了?

请问大神,听说高斯计算nbo 可以直接调用opt后chk文件就可以计算了,具体的输入格式是什么样子的呢?

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发表于 Post on 2017-8-4 20:48:42 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-4 10:45
请问大神,听说高斯计算nbo 可以直接调用opt后chk文件就可以计算了,具体的输入格式是什么样子的呢?

意义不明。
高斯里直接调用NBO算就pop=NBO
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发表于 Post on 2017-8-5 16:15:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-4 20:48
意义不明。
高斯里直接调用NBO算就pop=NBO

谢谢大神。
结构用高斯优化后,想接着算NBO。老师说可以直接调用优化得到的chk文件来计算NBO。
刚学量化很多都是自己摸索,有会的请不吝赐教

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发表于 Post on 2017-8-5 22:56:24 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-5 16:15
谢谢大神。
结构用高斯优化后,想接着算NBO。老师说可以直接调用优化得到的chk文件来计算NBO。
刚学量 ...

chk文件怎么可能算NBO,NBO程序又不支持以chk文件作为输入文件
你的基本逻辑关系还没搞清楚
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发表于 Post on 2017-8-6 10:51:45 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 my_aman 于 2017-8-6 10:54 编辑
sobereva 发表于 2017-8-5 22:56
chk文件怎么可能算NBO,NBO程序又不支持以chk文件作为输入文件
你的基本逻辑关系还没搞清楚

大神,有人按着这个输入文件文件在高斯上算NBO。他们是说直接调用chk 算NBO,但是我按着这种并不行。

KPSF{K{}6G{ZGN6A5D4%M4M.png (12.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 103)

KPSF{K{}6G{ZGN6A5D4%M4M.png

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发表于 Post on 2017-8-6 11:22:50 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-6 10:51
大神,有人按着这个输入文件文件在高斯上算NBO。他们是说直接调用chk 算NBO,但是我按着这种并不行。

不好意思大神,之前我没说清楚。我想问的是这里面的HgCl2-nbo1.chk文件是之前优化得到的chk  ??还是自己命名的

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发表于 Post on 2017-8-6 11:59:34 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-6 11:22
不好意思大神,之前我没说清楚。我想问的是这里面的HgCl2-nbo1.chk文件是之前优化得到的chk  ??还是自己 ...

那叫基于之前的chk里的数据作为初猜再做NBO,而不叫“调用chk 算NBO”
这任务实际上都没必要再写基组、赝势,直接用chkbasis就完了

既然都从chk里读数据了,显然得是之前优化等任务产生的。
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发表于 Post on 2017-8-6 12:38:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-6 11:59
那叫基于之前的chk里的数据作为初猜再做NBO,而不叫“调用chk 算NBO”
这任务实际上都没必要再写基组、 ...

关键词里直接加chkbasis吗??学习了,公社是我等初学者的福音。多谢社长不厌其烦的指教

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发表于 Post on 2017-8-6 21:15:57 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-6 12:38
关键词里直接加chkbasis吗??学习了,公社是我等初学者的福音。多谢社长不厌其烦的指教

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