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[Lammps] 求助:如何用Lammps计算xy轴的密度分布

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如图,想求助一下如何计算一下xy轴上的密度分布。本人小白,最好有详细的教程,麻烦了。

202403311512331006..png (75.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

xy轴上的密度分布

xy轴上的密度分布

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公社社长

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发表于 Post on 2024-3-31 15:20:58 | 只看该作者 Only view this author
我不用lammps,gromacs带的gmx densmap倒是可以直接给出这种图,可以考虑转换下格式后借用

北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里讲了具体例子

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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2024-4-1 09:45:43 | 只看该作者 Only view this author
VMD可以计算出x、y方向的密度曲线,然后可以根据VMD的TCL脚本导入origin里面画出二维密度云图

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发表于 Post on 2024-6-12 19:46:58 | 只看该作者 Only view this author
compute chunk/atom bin/2d命令可以输出相应数据

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 16:42:20 | 只看该作者 Only view this author
thor 发表于 2024-6-12 19:46
compute chunk/atom bin/2d命令可以输出相应数据

已解决了,感谢

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发表于 Post on 2024-7-3 22:07:59 | 只看该作者 Only view this author
chef 发表于 2024-6-20 16:42
已解决了,感谢

请问一下怎么是怎么做的

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发表于 Post on 2025-4-28 18:20:45 | 只看该作者 Only view this author
chef 发表于 2024-6-20 16:42
**** 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽 ****

请教一下是怎么做的呀

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