文献复刻限制性剪切问题

panda123321

我按照文献步骤：
1.建立碳纳米管和聚四氟乙烯AC packing盒子
2.对盒子采用结构优化，收敛，然后进行ANNEAL NVT系综（五次循环，300-500k，600ps退火），抽出结果中能量最低结构，继续进行NPT动力学弛豫，298k，标准大气压，2000ps过程。
3.抽出最低能量构型，跟铁分子建立LAYER，固定铁分子后进行结构优化至收敛，然后进行ANNEAL NVT系统（五次循环，300-500k，200ps退火），抽出能量最低构型。解除铁分子限制，Confined shear下NVT系综进行速度0.1A/S，600ps限制剪切模拟。
力场全程COMPASSⅢ
但是结果却是这样，想请大家看看存在什么其他问题，或者模拟过程是否有不合理之处，恳请大家赐教，谢谢。

chaojichaoji

添加应力了吗，文献中好像是通过脚本施加的力

WangCs

请问问题解决了吗

lht921119794

请问： 我的铁原子层不会划出，只是在原地抖动，是什么原因呢，解除了限制