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楼主 Author: 努力向上的boy
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[GROMACS] 如何在gromacs软件中,应用glycam力场以及gaff力场?

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发表于 Post on 2025-3-13 11:29:16 | 只看该作者 Only view this author
你好,博主,我现在也遇到和你一样的问题,我也想用gromacs模拟糖的力场,但是我用ambertools的时候转化我自己的mol2文件时显示找不到原子类型,我看了看和力场文件的原子类型是没有对上,我现在是想将自己的mol2文件转换成ambertools能够识别的文件,有什么好的方法和软件吗,我的mol2的文件是avogadro生成的,谢谢啦

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发表于 Post on 2025-4-16 17:38:34 | 只看该作者 Only view this author
chuxuedexiaobai 发表于 2023-7-1 13:20
您好,我想问一下糖类glycam力场文件是怎么生成的,我用这个网站没办法得到我自己想要的多糖的文件,然后画 ...

请问解决了吗
我也有相同疑问

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