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[综合讨论] 模拟晶体和气体的化合反应过程,如CaO晶体和CO2反应生成CaCO3晶体,跑AIMD可行吗

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楼主
对于气固反应,比如CaO和CO2,反应一段时间后,CaO的表面有一层CaCO3,CO2要通过CaCO3和CaO反应,在CaCO3中间层应该有离子扩散,想要模拟一下由CaO晶体转化为CaCO3晶体的形成过程。
因为还没有跑过AIMD,仅用vasp算过吸附和过渡态。不知道AIMD能不能模拟上述所说的反应(固体晶体和气体 生成另一固体晶体)?如果能的话,用什么软件合适?针对此类反应是否需要很多的计算时长?
希望大佬们能指点一二。谢谢。

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发表于 Post on 2020-7-26 00:50:25 | 只看该作者 Only view this author
QE、CP2K这些原理上都能跑
可以通过高温加快分子热运动使得在较短时间内就能观察到想要的现象
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-26 09:40:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-26 00:50
QE、CP2K这些原理上都能跑
可以通过高温加快分子热运动使得在较短时间内就能观察到想要的现象

多谢社长

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发表于 Post on 2020-8-5 14:18:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-26 00:50
QE、CP2K这些原理上都能跑
可以通过高温加快分子热运动使得在较短时间内就能观察到想要的现象


sob老师,如果想用VASP的AIMD模拟纯溶液体系,例如EC、DEC的电解液,这个算是孤立体系吗?
VASP的AIMD结果分析时,如何区分不同溶剂分子中的同种原子,例如EC和DEC 中的氧原子

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发表于 Post on 2020-8-9 04:15:33 | 只看该作者 Only view this author
adong 发表于 2020-8-5 14:18
sob老师,如果想用VASP的AIMD模拟纯溶液体系,例如EC、DEC的电解液,这个算是孤立体系吗?
VASP的AIMD ...

都凝聚相了,显然不是孤立体系

这跟VASP没直接关系,是轨迹分析程序的事。诸如在VMD里结合残基名和原子名,或者通过原子序号,可以选定不同分子中的氧
VMD里原子选择语句的语法和例子
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发表于 Post on 2020-8-9 10:24:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-9 04:15
都凝聚相了,显然不是孤立体系

这跟VASP没直接关系,是轨迹分析程序的事。诸如在VMD里结合残基名和原 ...

谢谢sob老师

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