VMD怎么加载VASP算好的差分电荷密度呢

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2019-12-1 14:33:13

本帖最后由 qwe1832518773 于 2019-12-2 14:21 编辑

该问题已经解决，感谢啦啦黑还黑的回复以及社长博客的启发！

算好的CHGCAR_diff可以用脚本chg2cube.pl来转化成cube文件，后者就可以在vmd里打开，具体的图片调教我是参考的社长的vmd脚本（http://sobereva.com/449）

-----以下是原问题--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
看到有一篇文献 Phys. Chem. Chem. Phys., 2015, 17, 14495

Molecular functionalization of silicene_Ag(111) by covalent bonds_ a DFT study.pdf (4.22 MB, 下载次数 Times of downloads: 41) 里用VMD画了很好看的等密度电荷图，但是自己将算好的CHGCAR_diff拖入VMD后VMD直接卡死奔溃了。。。像求助一下究竟该怎么操作才能画出这样的图呢

啦啦黑还黑 · 发表于 Post on 2019-12-1 16:04:53

建议用Vesta看。如果非要用VMD，先在VESTA里转成cube格式的文件，再导入到VMD

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2019-12-1 20:06:40

啦啦黑还黑发表于 2019-12-1 16:04
建议用Vesta看。如果非要用VMD，先在VESTA里转成cube格式的文件，再导入到VMD

好的我试试，谢谢

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2019-12-1 20:11:23

本帖最后由 qwe1832518773 于 2019-12-1 20:13 编辑

啦啦黑还黑发表于 2019-12-1 16:04
建议用Vesta看。如果非要用VMD，先在VESTA里转成cube格式的文件，再导入到VMD

vesta该怎么转成cube格式呢，我在export里面没有找到cube格式，我的vesta版本是3.4.3

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[VASP] VMD怎么加载VASP算好的差分电荷密度呢