求助 VASP结构优化结果出现原子丢失的问题

aurberon · 发表于 Post on 2019-8-4 08:48:36

本帖最后由 aurberon 于 2019-8-4 08:56 编辑

求教各位老师，我建立3*3*3的Al原子超胞，中间替换3个为Cu原子，然后按照分步优化的方法，第一步固定所有原子（用Selective dynamics），优化晶格参数（ISIF=3），接着用上一步的CONTCAR作为POSCAR 去掉 Selective dynamics 设置的F ，弛豫离子位置 ISIF=2，优化后的CONTCAR导入VESTA发现少了一些原子，这是怎么回事呢？要怎么才能正常优化呢？
我用的是VASP5.4.4 版本

INCAR文件如下：
SYSTEM = AlCu108

ENCUT = 500
NELMIN = 5
NELMAX = 100
ISTART = 0
ICHARG = 2
NPAR = 4
ISPIN =1
ISYM = 0
LREAL = .FALSE.
SIGMA = 0.2
ISMEAR = 0
GGA = PE
EDIFF=1E-7
EDIFFG= -0.001
PREC = Accurate
NSW = 100
IBRION =2
ISIF = 2
POTIM = 0.2

hakuna · 发表于 Post on 2019-8-4 13:25:44

只是显示问题

aurberon · 发表于 Post on 2019-8-4 14:40:58

显示问题有办法能正常显示吗？

hakuna · 发表于 Post on 2019-8-4 19:37:28

aurberon 发表于 2019-8-4 14:40
显示问题有办法能正常显示吗？

因为参杂的缘故，你优化时边缘原子的位置有小的改变，所以在某一侧面显示不出来

aurberon · 发表于 Post on 2019-8-5 17:41:56

hakuna 发表于 2019-8-4 19:37
因为参杂的缘故，你优化时边缘原子的位置有小的改变，所以在某一侧面显示不出来

但是我旋转任意角度都看不到啊

Walden · 发表于 Post on 2019-8-21 21:59:32

查看超胞就会发现没有少，只是显示的原因，输出文件中的原子个数还是一样的。

aurberon · 发表于 Post on 2019-8-28 10:43:58

Walden 发表于 2019-8-21 21:59
查看超胞就会发现没有少，只是显示的原因，输出文件中的原子个数还是一样的。

好的谢谢我算放心了

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