求助差分密度图的调整

華華 · 发表于 Post on 2019-4-29 11:05:54

求助各位老师，看文献中的差分密度图是第一张图这样的，但是我在DMOL3中画出来的电子密度红蓝的颜色特别不明显（第二张图），请问怎么才能调出文献中这样的呢？期待您的解答，万分感谢！！！

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-29 14:31:52

上头那是截面图，你的是等值面图。把透明改成不透明还能看着区分度高一些

華華 · 发表于 Post on 2019-4-30 15:36:22

sobereva 发表于 2019-4-29 14:31
上头那是截面图，你的是等值面图。把透明改成不透明还能看着区分度高一些

谢谢sob老师的解答

華華 · 发表于 Post on 2019-4-30 16:02:29

老师好，按老师说的我做出了截面图，第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的，第二张图是按一些帖子说的AB-A-B计算密度差得到的，但是有些问题想请教一下
1、第二张图中的蓝色中间有红色，那这种的话是得电子还是失电子呢，还是画的图有什么问题呢？
2、如果要分析吸附结构的电子得失直接用第一个可以吗？O原子得电子，Ti失电子，但是在Ti原子上有点红色，但是其他周围是蓝色这种应该怎么分析呢？
3、在文献中的 charge density difference可以用来说明图一吗？
刚开始接触性质的分析，希望得到老师的指点，万分感谢！！！

hakuna · 发表于 Post on 2019-4-30 16:52:16

華華发表于 2019-4-30 16:02
老师好，按老师说的我做出了截面图，第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的，第二 ...

密度差只能定性地讨论一下电荷转移情况，能用等直面就不要去切面，要切就要弄准确位置，随便切一个出来，神见了也发愁。
别期待通过密度差讨论原子的电子得失，讨论原子还是算电荷密度吧
密度差图上可以尝试把得、失电荷的区域与轨道对应一下，分析电荷转移状况，可以查看吸附位原子间是否有点和聚集.....最好与DOS关联起来对理解会有帮助

華華 · 发表于 Post on 2019-4-30 17:07:15

hakuna 发表于 2019-4-30 16:52
密度差只能定性地讨论一下电荷转移情况，能用等直面就不要去切面，要切就要弄准确位置，随便切一个出来， ...

您好，我就是看文献里很多都是DOS和电荷密度差分析的，所以想做一下密度差，切截面的话是应该分析哪些原子就切那个面吗？我这个面切的是SO2和表面上的一个Ti原子，主要是想学习一下，切截面有哪些技巧吗？谢谢您的解答

hakuna · 发表于 Post on 2019-4-30 17:23:56

華華发表于 2019-4-30 17:07
您好，我就是看文献里很多都是DOS和电荷密度差分析的，所以想做一下密度差，切截面的话是应该分析哪些原 ...

分析哪里切哪里

華華 · 发表于 Post on 2019-4-30 19:29:42

hakuna 发表于 2019-4-30 17:23
分析哪里切哪里

明白了，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-1 06:25:16

華華发表于 2019-4-30 16:02
老师好，按老师说的我做出了截面图，第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的，第二 ...

定量讨论原子上电荷的净变化量应当用原子电荷来考察。比如Hirshfeld电荷就相当于在Hirshfeld原子空间中对密度差这个函数进行积分取负值

華華 · 发表于 Post on 2019-5-2 19:05:15

sobereva 发表于 2019-5-1 06:25
定量讨论原子上电荷的净变化量应当用原子电荷来考察。比如Hirshfeld电荷就相当于在Hirshfeld原子空间中对 ...

谢谢sob老师的解答

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