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[Amber] amber调用gaussian做qmmm报错

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楼主
用amber调用gaussian时提示SANDER BOMB in subroutine get_gau_forces (qm2_extern_gau_module)
Error with system call (executing Gaussian),请问这是什么原因? 输出文件见附件

qmmm.out

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发表于 Post on 2018-12-28 12:49:52 | 只看该作者 Only view this author
看提示
| Program g16 not found!
| Program g09 found!
| Executable location: /home/lengedhao/g09/g09
应该是路径没设对
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-29 11:00:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-28 12:49
看提示
| Program g16 not found!
| Program g09 found!

老师,应该不是路径的问题,因为我测试了下把qm区域选小点,程序能正长跑。实际上去掉一个磷酸二脂键和紧邻的碳原子程序就能跑。这是什么原因,是因为磷酸建不适合这个基组吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-29 12:30:31 | 只看该作者 Only view this author
高斯的输出

gau_job.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-29 14:43:55 | 只看该作者 Only view this author
找到原因了,自旋是1不是2

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