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[GROMACS] 请问gromacs是否能做氢键个数的分布

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请问各位老师,gromacs中的gmx hbond命令提供了-dist 和-ang提供了H键的距离和角度分布。如果我想做H键个数的分布有没有直接的选项,手册看了一遍没找到。谢谢!

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发表于 Post on 2018-7-4 02:16:32 | 只看该作者 Only view this author
"个数的分布"具体怎么定义?-nhbdist达不到目的?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-4 07:39:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-7-4 02:16
"个数的分布"具体怎么定义?-nhbdist达不到目的?

谢谢sob老师。“个数的分布”我想表达的是在所有的frame中,1个H键占的比例,2个H键占的比例等等。这个我昨晚想到可以从hbnum中写个脚本统计一下。但好像-nhbdist没有此类输出。

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发表于 Post on 2018-7-4 08:16:55 | 只看该作者 Only view this author
基于-nhbdist输出的文件,很容易就统计出来了,excel都行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-4 08:37:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-7-4 08:16
基于-nhbdist输出的文件,很容易就统计出来了,excel都行

好的,谢谢sob老师。

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