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计算晶面上的溶剂可及面积,采用MS软件中的atom volume&surface计算?

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发布时间: 2018-1-11 08:49

正文摘要:

各位大神,我想计算晶面上的溶剂可及面积,但是不知道具体用MS怎么操作??有人会吗

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caijingtao1993 发表于 Post on 2018-1-12 18:58:01
xylz6188 发表于 2018-1-12 14:22
1、是;2、不能为零,至少也得默认值;3、都可以试试,取决于你的研究体系;4、参数最好的办法就是找一个 ...

谢谢,幸苦了
xylz6188 发表于 Post on 2018-1-12 14:22:03
caijingtao1993 发表于 2018-1-12 12:07
非常感谢,我用了该tools,计算Aacc,也就是溶剂可及表面积,这个采用tools中的atom volume&syrface的con ...

1、是;2、不能为零,至少也得默认值;3、都可以试试,取决于你的研究体系;4、参数最好的办法就是找一个相似的参考体系(有实验数据)一一测试;5、不能取0;这个,你可以试试;6、最好读一下里面的帮助

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caijingtao1993 发表于 Post on 2018-1-12 12:07:35
xylz6188 发表于 2018-1-12 11:30
Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >

非常感谢,我用了该tools,计算Aacc,也就是溶剂可及表面积,这个采用tools中的atom volume&syrface的connolly surface来计算对吗?关于此则connolly 半径设置为0吗??还是用solvent task还是both task??这些参数是怎么设置的?计算晶面面积connolly半径取0?还是直接计算盒子的底面积a*b*sina?那么容积可及面积这些参数怎么取值,求教,大神
xylz6188 发表于 Post on 2018-1-12 11:30:10
Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >

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