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trjconv处理轨迹问题

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发布时间: 2017-11-17 21:12

正文摘要:

为什么使用GROMACS的trjconv程序处理轨迹时。每个时刻都会在gro文件中显示时刻(图1)。而不是连续的(图2)只在最开始显示一个时刻。

回复 Reply

wbn 发表于 Post on 2017-11-19 11:43:39
guoy14iccas 发表于 2017-11-18 14:12
谢谢您的回复,是100个分子。10ns每10ps保存一帧,最终的gro文件仍旧只是显示初始时刻。中间的不会显示

图2是在一帧的中间,不是两帧的交界处
guoy14iccas 发表于 Post on 2017-11-18 14:12:50
wbn 发表于 2017-11-18 07:54
图2中一帧还没完呢只是第一个分子写完了怎么会显示时刻

谢谢您的回复,是100个分子。10ns每10ps保存一帧,最终的gro文件仍旧只是显示初始时刻。中间的不会显示
wbn 发表于 Post on 2017-11-18 07:54:08
图2中一帧还没完呢只是第一个分子写完了怎么会显示时刻
guoy14iccas 发表于 Post on 2017-11-17 21:40:36
我发现当只有一个分子时会显示所有时刻,多个分子时就不会一一显示出来这个时刻,想知道是不是程序默认这么干的? 请教各位,谢谢。

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