使用隐式溶剂报错 cannot find length for atoms involved in angle

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发布时间: 2017-11-13 21:50

我在使用隐式溶剂的时候，出现了这个报错，我在top中并没有定义这两个原子之间有键角，关键是在实际结构中这两个原子八杆子打不着，真的很纳闷为什么会有这样的问题。我在mdp文件中加上了implicit-solvent = GBSA& ...

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sobereva 发表于 Post on 2017-11-14 13:06:39

jase20 发表于 2017-11-14 10:59
谢谢老师，还是不行....不过请问top中的原子编号一定是要从1按顺序开始编号吗？

不一定有这个要求，反正我是没见过moleculetype里有原子序号不从1开始的情况

jase20 发表于 Post on 2017-11-14 10:59:58

sobereva 发表于 2017-11-14 01:31
gmx2016.4试试？

谢谢老师，还是不行....不过请问top中的原子编号一定是要从1按顺序开始编号吗？

sobereva 发表于 Post on 2017-11-14 01:31:04

gmx2016.4试试？

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