gmx energy计算库伦作用的问题

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发布时间: 2017-11-9 11:16

请问 43 coul-SR A-A ，这里面的A是带正电的组分，为什么计算出来的数值会是负值？还有当A只有一个带正电分子的时候为什么也会有数值，而且数值为负数？还请各 ...

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1427437701 发表于 Post on 2017-11-9 15:31:03

sobereva 发表于 2017-11-9 15:27
如果A组就是这个MEY，那我也不清楚，理应不应该有负值

好的，谢谢老师！

sobereva 发表于 Post on 2017-11-9 15:27:03

1427437701 发表于 2017-11-9 15:03
我这个分子好像所有的原子都带正电，计算的coul-SR是 -340，请问老师，这是哪里出错了？

如果A组就是这个MEY，那我也不清楚，理应不应该有负值

sobereva 发表于 Post on 2017-11-9 13:51:43

我不清楚你的体系的具体构成，A是一个还是多个分子、怎么分布的，负值不是不可能出现的。
只有一个带正电分子时，分子内部正负电荷相互作用，可以令分子内部静电作用为负（只要分子内有带负电荷的原子，就有这种可能，比如就两个原子，一个是+2.0，一个是-1.0，整体带+1.0）

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