如何理解手册中非键参数的组合规则以及其与LJ势公式的关系？

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发布时间: 2017-10-16 22:00

本帖最后由 jase20 于 2017-10-16 22:01 编辑各位老师同学好，在GROMACS手册的4.1.1节中写了LJ公式，给了两个形式（公式4.3和公式4.5）。同样在手册的5.3.2这一节的nonbond_param这一节中，写了参数V（C6或者sig ...

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sobereva 发表于 Post on 2017-10-17 22:17:43

jase20 发表于 2017-10-17 22:11
谢谢老师，那非键参数那一节的意思就是说对于不同的组合规则，使用的公式形式不同是这样吗？那如果定义W ...

jase20 发表于 Post on 2017-10-17 22:11:29

fhh2626 发表于 2017-10-16 23:50
https://en.wikipedia.org/wiki/Lennard-Jones_potential

谢谢啦

jase20 发表于 Post on 2017-10-17 22:11:19

sobereva 发表于 2017-10-16 23:13
有很简单的转换关系

谢谢老师，那非键参数那一节的意思就是说对于不同的组合规则，使用的公式形式不同是这样吗？那如果定义W为零，也就是epsilon为零，那整个LJ势能函数的值不就为零了吗？这如何理解呢？

fhh2626 发表于 Post on 2017-10-16 23:50:01

https://en.wikipedia.org/wiki/Lennard-Jones_potential

sobereva 发表于 Post on 2017-10-16 23:13:11

有很简单的转换关系

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