cym 发表于 2025-6-19 08:58
卢老师，本人拜读了您的文章。现在有一个疑问。

请问文章中 Figure 8 中苯环形成的过程，过渡态不是应该 ...

只有一个虚频
虚频数和反应中途成键/断键数目不是一码事，也没有直接联系。多个键同时形成/断裂的基元反应，过渡态也只有一个虚频。

卢老师，本人拜读了您的文章。现在有一个疑问。

请问文章中 Figure 8 中苯环形成的过程，过渡态不是应该只有一个虚频吗，C1-C5和C4-C6相互靠近，是不是会形成两个虚频？

sobereva 发表于 2017-9-28 13:02
1 赝势基组下不好判断情况，不用赝势赝化的电子数还不同等等
2 有

那以后对于复杂的情况尽量不扣除内核电子的办法进行波函数分析吧，多谢大博士

我本是个娃娃 发表于 2017-9-28 12:05
了解了，但问题有二：

1，为什么全电子基组下Multiwfn可以扣除3d和3p轨道而赝势基组下不可以？

1 赝势基组下不好判断情况，不用赝势赝化的电子数还不同等等
2 有

sobereva 发表于 2017-9-28 10:16
def2-TZVP的情况是合理的，本来扣掉内核电子后，ELF图那里就应当没有等值面。而绘制价层电子密度图，可以看 ...

了解了，但问题有二：

1，为什么全电子基组下Multiwfn可以扣除3d和3p轨道而赝势基组下不可以？

2，扣除了内层轨道后对于分析Fe原子附近的ELF的分析是否有影响？毕竟没有扣除的时候这里的ELF也是很明显的。

sobereva 发表于 2017-9-27 21:45
Multiwfn是按照原子序数判断应该有多少个内核轨道，从而把最低那些MO的占据数清零。如果你是这么做的， ...

根据大博士的意见，我重新检查了一下三个波函数经过修改前后的轨道数和电子数，列举如下

载入波函数文件后，选择主选项6，然后选择子选项34，得到

def2-TZVP：48个占据轨道。经过修改后删掉内层19个占据轨道，剩下29个占据轨道。
lanl2TZ：43个占据轨道。经过修改后删掉内层10个占据轨道，剩下33个占据轨道。
SDD：43个占据轨道。经过修改后删掉内层10个占据轨道，剩下33个占据轨道。


可见，Multiwfn对def2-TZVP的波函数多扣除了4个内层轨道，共计8个电子。

我本是个娃娃 发表于 2017-9-27 19:37
不单开帖了，就在这里回复一下吧。测试了一下二茂铁在全电子基组和赝势基组下的ELF图。

Multiwfn是按照原子序数判断应该有多少个内核轨道，从而把最低那些MO的占据数清零。如果你是这么做的，之后重新检查一下各个轨道占据数和轨道特征，看是否有问题。

不单开帖了，就在这里回复一下吧。测试了一下二茂铁在全电子基组和赝势基组下的ELF图。


Level：
GEO： B3LYP/6-311G*(6-311G*)/Fe(SDD)
SP：B3LYP/6-311G*(6-311G*)/Fe(def2-TZVP，lanl2TZ，SDD)



看来赝势基组下，如果扣除内部的电子密度，对于实空间函数的分布没有影响。
唯一有问题的是def2-TZVP下，扣除内部电子密度后，铁原子上的ELF分布怎么没有了？是我做的不对还是另有原因？

我本是个娃娃 发表于 2017-9-27 14:42
可否这样认为，相当于在波函数分析的层面上对所分析的原子使用了赝势，将内层电子进行了赝化，从而更好地表 ...

类似这个含义

可否这样认为，相当于在波函数分析的层面上对所分析的原子使用了赝势，将内层电子进行了赝化，从而更好地表现价层电子的行为？