wudazhuang509 发表于 2017-9-26 18:55 如果你只想显示某些原子贡献的MO部分,看此文,在Multiwfn里可以选择去掉某些原子的贡献 使用Multiwfn观看分子轨道 http://sobereva.com/269 |
wudazhuang509 发表于 2017-9-25 22:18 你先选100(自定义函数),然后才会让你选择作图类型。平面图的绘制例子参考手册4.4节 可以贴图,见置顶的新人必读里关于贴图方式的说明。 在Multiwfn主功能0里可以直接看cube文件等值面,会看到等值面分布明显严重偏离原子坐标。用VMD看也是一样的问题。至于CP2K的设置我不太清楚。 |
sobereva 发表于 2017-9-25 21:25 4 -10 Return to main menu -2 Obtain of deformation property -1 Obtain of promolecule property 0 Set custom operation 8 Electrostatic potential from nuclear charges 14 Reduced density gradient(RDG) with promolecular approximation 16 Sign(lambda2)*rho with promolecular approximation 100 User defined real space function, iuserfunc= -1 sob老师,回复好像不能贴图,上面是我复制的主功能4下面的选项 |
sobereva 发表于 2017-9-25 21:25 谢谢老师的回答。 不好意思,我没注意到文件大小,以后会注意的。 sob老师您说的格点数据原点和原子位置不对应,是因为我的原子坐标不是在0为中心取造成的么?同时我试过把cube文件放入Multiwfn中,主功能4下面没有出现像手册中讲的等值线图(选项4),这个怎样解决呢? |
原理上用Multiwfn可以,把settings.ini里iuserfunc设-1(目的是令自定义函数对应格点数据插值的函数),再启动Multiwfn,载入cube文件,然后用主功能4绘制用户自定义函数的等值线图。但是你的cube文件里格点数据原点和原子位置貌似不对应,还没法直接这么操作。 PS:上传cube等ASCII型文件时建议先压缩下以节约论坛空间。 |
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