如果知道结构信息或者知道CAS也可以在SCIFinder上面通过结构式或者CAS来搜索,一般的化合物是可以下载到.mol文件的 |
CayJ 发表于 2018-8-16 10:33 一般获得分子结构的途径 用gview等程序画个基本靠谱的结构,然后用Gaussian、ORCA等量化程序做几何优化 |
LGC020305 发表于 2018-8-15 22:42 哦原来是这样,我不了解如何定分子中各个原子坐标的,刚开始学量子化学 |
CayJ 发表于 2018-8-15 17:00 难道xyz 坐标不一样就不是同一个分子吗? 例如H2, 第一套xyz坐标 H1 0.0 0.0 0.0 H2 0.0 0.0 0.74 第二套xyz坐标 H1 0.0 0.0 0.0 H2 0.74 0.0 0.0 这两套坐标是不是都是H2???不同的软件生成的坐标也许不一样(中心坐标选择不同,以及原子编号不同),并不是说绝对结构不一样. |
sobereva 发表于 2018-8-15 16:18 老师,我不是很懂,我正在学习Exploring Chemistry with electronic structure methods,我发现此文章里的分子结构式的笛卡尔坐标与Chem3D里的不一致,这是为什么?有对错之分吗? |
CayJ 发表于 2018-8-15 15:09 因为文献里不是以这种方式得到的水的笛卡尔坐标 |
为什么在Chem3D中得到水的笛卡尔坐标会与文献中的不同? |
冰释之川 发表于 2017-7-16 13:45 很有用 |
openbabel |
不知道文献的supporting里是否会提供坐标信息 |
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