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含Ga3+金属离子配体的参数化，基组选择问题

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chao831

发布时间: 2025-8-21 20:06

正文摘要:

各位老师同学好, 本人量子小白，想请假一下各位老师和前辈之前有给含有金属离子的药物分子（如图，含有一个Ga3+离子在螯合部分）做配体参数化，用于之后gromacs跑动力学。当时只参考了amber网站上的 ...

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sobereva 发表于 Post on 6 hour ago

Gaussian自带的SDD对Ga没极化函数，不建议用，还不如6-31G*的描述质量。6-31G*描述Ga可以接受，对Ga若要用赝势基组节约时间，至少用lanl08(d)，下文有说明
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373（http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html）

注意正确拼写Gaussian

推荐用sobtop（http://sobereva.com/soft/Sobtop）产生这个的拓扑文件

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