模拟nvt过程中，所设的截断值发生改变

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发布时间: 2025-7-26 22:17

老师们，我模拟li在聚合物固态电解质传输体系，含有18880个原子，然后盒子大小24*24*24，在能量最小化过程结束后，进行nvt弛豫，截断值在nvt.mdp我设置的是1.2nm,但刚开始模拟就出现图中情况，截断半径成为1.875nm， ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-7-28 01:16:20

没有什么不合适的。gromacs自动给你改成了计算效率最高的cutoff，这不会影响静电作用的计算精度

KazusaT 发表于 Post on 2025-7-27 05:03:02

mdrun命令有一个选项tunepme，会自动优化傅立叶变换格点数和截断半径来平衡负载，具体的可以看看手册
-[no]tunepme (yes)

Optimize PME load between PP/PME ranks or GPU/CPU

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