计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助输入文件中geom=connectivity与结构优化的关系

查看数: 424 | 评论数: 10 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
zyd
发布时间: 2025-7-4 08:09

正文摘要:

老师们好。我有一个问题想请教一下: 这一组是文件1 两者的区别是有无geom=connectivity,我想问的是: (1)初始结构不是要有明确的成键关系(方式二)这样优化比较快,结构会比较合理。像方式一那 ...

回复 Reply

zyd 发表于 Post on 2025-7-5 12:01:40
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-7-4 19:21
这样吗,能直接给周期性体系算ECD的软件确实没怎么听说过,也就去年http://bbs.keinsci.com/thread-46607 ...

谢谢您的解答,我去看一下
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-7-4 19:21:19
zyd 发表于 2025-7-4 15:04
谢谢您的建议,我也想过这样优化结构,那么这样的体系在优化之后,可不可以计算圆二色光谱呢,我不太清楚 ...

这样吗,能直接给周期性体系算ECD的软件确实没怎么听说过,也就去年http://bbs.keinsci.com/thread-46607-1-1.html提了一下。就是要取团簇来算ECD的话,或许比较推荐的是ORCA结合背景电荷和embedding potential来表现晶体环境,但有没有文献这么算过我也不清楚了。当然这不妨碍前一步的晶体变胞优化用严格考虑三维周期性的程序,毕竟功能支持不同是很合理的切换软件计算的理由。
zyd 发表于 Post on 2025-7-4 18:56:58
2877321934 发表于 2025-7-4 17:48
见此博文:
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD和VCD光谱图
http://sobereva.com/224

谢谢之前一直没注意其中的一部分内容,现在多亏您的提醒
2877321934 发表于 Post on 2025-7-4 17:48:43
zyd 发表于 2025-7-4 15:04
谢谢您的建议,我也想过这样优化结构,那么这样的体系在优化之后,可不可以计算圆二色光谱呢,我不太清楚 ...

见此博文:
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD和VCD光谱图
http://sobereva.com/224
zyd 发表于 Post on 2025-7-4 15:04:26
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-7-4 13:19
可是实际晶体里“无机骨架”按三维周期性无限延展,而且无论是否局域,远处的骨架原子都会与有机分子产生 ...

谢谢您的建议,我也想过这样优化结构,那么这样的体系在优化之后,可不可以计算圆二色光谱呢,我不太清楚有什么软件能做,只知道高斯
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-7-4 13:19:11
zyd 发表于 2025-7-4 13:05
这个我们是想看看在局域状态,有机分子构象变化对无机骨架畸变的影响

可是实际晶体里“无机骨架”按三维周期性无限延展,而且无论是否局域,远处的骨架原子都会与有机分子产生静电和范德华等相互作用;而简单小型孤立团簇的表面效应很显著,并不能真实表现晶体的环境。你的目的应该构建周期性晶体结构的超胞模型,用第一性原理程序做变胞优化或NPT系综分子动力学任务来考察。
zyd 发表于 Post on 2025-7-4 13:05:06
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-7-4 09:45
这是个铵盐、溴与铅构成的钙钛矿么?扣出一个孤立团簇直接拿Gaussian优化没有什么意义,建议改用CP2K等第一 ...

这个我们是想看看在局域状态,有机分子构象变化对无机骨架畸变的影响
zyd 发表于 Post on 2025-7-4 13:02:59
wal 发表于 2025-7-4 09:04
geom=connectivity与量化计算毫无关系,不会产生任何影响

好的谢谢
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-7-4 09:45:16
这是个铵盐、溴与铅构成的钙钛矿么?扣出一个孤立团簇直接拿Gaussian优化没有什么意义,建议改用CP2K等第一性原理程序,对晶体结构做周期性计算。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
北大-陶豫 + 5 我很赞同

查看全部评分 View all ratings

wal 发表于 Post on 2025-7-4 09:04:39
geom=connectivity与量化计算毫无关系,不会产生任何影响

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 08:21 , Processed in 0.512786 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list